Ein Molybdänmangel ist noch nie bei gesunden Personen beobachtet worden.
Der einzige dokumentierte Fall eines Molybdänmangels wurde bei einem Patienten mit Morbus Crohn dokumentiert, der langfristig intravenös und ohne Molybdänzusatz ernährt worden war. Er entwickelte Tachykardie (Herzrasen), eine schnelle flache Atmung, Kopfschmerzen, wurde nachtblind und fiel schließlich in ein Koma. Des Weiteren wies sein Blut niedrige Harnsäurewerte auf. Diese Symptome und Blutveränderungen verschwanden, als die Infusion mit Aminosäuren eingestellt wurde, was darauf hinweisen könnte, dass Molybdän bei der Verstoffwechselung von Aminosäuren eine wichtige Rolle spielt.
Durch die Zufuhr von 160 Mikrogramm Molybdän pro Tag wurde diese Aminosäurenintoleranz aufgehoben.