Mangan spielt eine wichtige Rolle in vielen Stoffwechselprozessen des menschlichen Körpers als Aktivator von Enzymen und als Bestandteil von Enzymen:

Zahlreiche Mangan-aktivierte Enzyme spielen eine wichtige Rolle im Kohlenhydrat-, Aminosäure- und Cholesterin-Stoffwechsel sowie in der Gluconeogenese – die Herstellung von Glucose aus Nicht-Kohlenhydrat-Vorläufern – und im Harnstoff-Stoffwechsel – wichtig für die Entgiftung von Ammoniak. Des Weiteren ist Mangan ein bevorzugter Cofaktor des Enzyms Glykosyl-Transferase, welches notwendig ist für die Herstellung von Proteoglykanen, die von großer Bedeutung für die Bildung von Knorpel und Knochen sind – und damit für deren Gesundheit.

Mangan ist Bestandteil der Mangan Superoxid Dismutase (MnSD), dem wichtigsten antioxidativen Enzym in den Mitochondrien, den Kraftwerken der Zelle. Da über 90 % des Sauerstoffs, der in den Zellen benötigt wird, in den Mitochondrien verbraucht wird, erklärt sich die besondere Bedeutung dieses Enzyms: Es überführt die bei der Oxidation entstehenden Superoxid-Radikale in Wasserstoffperoxid, welches durch andere Enzyme zu Wasser reduziert und damit entsorgt wird.

Mangan ist von Bedeutung für die Hautheilung und -regeneration: Es wird benötigt für die Herstellung der Aminosäure Prolin, die wiederum für die Kollagenbildung in den Hautzellen wichtig ist.