Ein schwerer Mangel an Vitamin B6 kommt selten vor.
Untersuchungen haben gezeigt, dass Thiamin notwendig für einen korrekte Verstoffwechselung und Funktion von Vitamin B6 ist. Daher haben Alkoholiker, die auf Grund der geringen Nahrungsaufnahme auch einen Thiaminmangel aufweisen, das höchste Risiko, auch an den Auswirkungen eines Vitamin-B6-Mangels zu leiden.
Einige Studien haben abnormale Elektroenzephalogramme (EEGs) bei einem Vitamin-B6-Mangel dokumentiert. Andere neurologische Symptome die bei einem schweren Mangel auftreten sind Reizbarkeit, Depression, und Verwirrung. Andere Symptome sind Glossitis (Entzündungen der Zunge), Wunden beziehungsweise Geschwüre im Mund sowie Rhagaden (Risse und Geschwüre) an den Mundwinkeln.